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表章，特跟随着锦衣卫押解林德远的人马送入了京师。但朱平安不会等待京师的消息，直接便命令岳锦峰、仇泽、李定国带领精心挑选的一干手下前去上任，趁热打铁，将四卫的局势稳定下来。接下来便是编连士卒、重组新军，老弱病残一律纳入辅兵行列。

包括都司衙门也开始大刀阔斧的整饬，蓬莱城防需要加固，尤其是添置火炮，打造火铳，更是要提到议事日程上来。其二便是三个新部门的设立。如今大明朝廷还是天下的正统，朱平安也没有傻到要改变军制、衙门内部的结构的地步，那样纯粹是再找麻烦，等于是将口实送到了御史言官的手中。新增设的三个机构只能是先作为临时部门来设立，但其权限，不可谓不大。

第一便是督查室。朱平安考虑的很周全，现在还是大明，还用后世的那一套来实现对整个衙门的监督绝对是不适合的。所以，也只能以后世的经验来逐步适应大明的国情，一步一步来摸索着前进。督查室便是其中最重要的一个部门。

朱平安的手下，虽然目前来说还处于一种相对清廉、纯洁的状态，但毕竟处于整个大明社会中，难保不会受到什么不良习气的沾染，这便需要有一个机构来对其进行监督控制，于是督查室应运而生。

督查室不隶属于任何部门，也只对朱平安一人负责。人员有督查室主任挑选，然后报朱平安批准，然后才可招募进入该部门。朱平安的设想是，未来督查室将作为一个对内的情报部门存在，而监督检查的职责将交转移给真正的纪律监察部门，实现权力的相互制衡。但现在还不到时机，只能作为一个雏形来逐步发展。

督查室的第一任主官，朱平安任命了郭追来担任。从严格意义上来说，郭追不属于朱平安麾下的中都系统人马，倒是和李定国一样都属于新加入的派系，虽然和王承恩有着紧密的联系，但事实已经表明，王承恩和朱平安本身也是一而二、二而一的关系，所以，作为一个刚刚加入的外来者，郭追倒是很适合做这项工作。

第二个部门便是研究所。主官是孙和鼎。何长水、以及王承恩特意找来的几名曾跟随毕懋康研究燧发枪的工匠，以及中都时便跟随主朱平安的匠户将成为这个部门的核心成员。等到研究所不如正轨之后，朱平安还打算将何长水从研究所中抽调出来，成立军械制作局，将科研和制造分为两个独立的部门。而马夫王之所以没有进入研究所，则是因为朱平安认为，他医学上的造诣远远高于他在研究某些歪门邪道方面的水平。朱平安打算在实际合适的时候，成立军队的战地医疗部门，马夫王将是最合适的人选。

之后，研究所还将补充进入一批精兵强将。包括，孙和鼎的两个弟弟，孙和斗、孙和京。还有朱平安很感兴趣的两个人，一个是王徵，还有一个是张涛，两人都是孙元化主政登莱时期的研制铸造新式火器的骨干人物。

其中王徵已经年逾六旬，身体情况不佳，虽然婉拒了孙和鼎和朱平安的邀请，但却推荐了自己的两个学生前来登州。而《西洋火攻图说》的作者张涛则在广东一带游历，孙和鼎专门请自己的弟弟孙和京赶赴广东寻找，相信不久之后便会有消息传来。

而第三个，则是货真价实的情报部门。斩决决定很大意义上是被情报工作所左右的。朱平安从后世的经验来看，成王败寇除了天时地利人和的因素，最关键的原因便是消息的掌控程度。大战未始，情报先行，这是毫无疑问的。

军情处应运而生。第一任主官，自然是阴世纲。情报网络是现成的，只要将朱平安原本建立起来的情报网络雏形与沈名先掌握的机构合二为一，便可以组建起一套完整的覆盖于整个山东的情报网络。接下来要做的，便是要按照朱平安所编撰的关于情报工作的指导意见和工作纪律等一系列教材对情报工作进行改良完善。其中包括、联络、暗语